O coronavírus (Covid-19) causou pânico, preocupação e resultou em estado endêmico em todo país. O primeiro caso da infecção na Bahia foi confirmado na primeira semana de Março de 2020, assim como aconteceu nos outros estados do país. Apesar de se assemelhar com os sintomas de um resfriado, os sinais do coronavírus podem ser ainda mais graves, causando dificuldade de respirar, tosse, febre etc. A transmissão acontece sempre de forma rápida através de gotículas de saliva, contato com pessoas ou objetos/ superfícies contaminadas. Desta forma, a Secretária da Saúde do Estado da Bahia (Sesab) apressou-se para criar um plano de controle, a fim de evitar uma superlotação nos leitos de UTI de todo o estado.
Desde o início da pandemia, foram registrados na Bahia mais de 1,5 milhão de casos de coronavírus, resultando em aproximadamente 31 mil mortes. A Sesab recomendou medidas de higiene e o Governo do Estado da Bahia sancionou o lockdown durante o decorrer do ano de 2020. Apesar da urgência óbvia, as primeiras doses de vacina foram aplicadas no início de 2021 e até hoje o estado segue o seu plano de contingência para imunização do novo coronavírus (Covid-19).
O aparecimento de novas cepas do vírus tem preocupado e por esse motivo o Sesab reforça a importância das doses de reforço, especialmente em crianças, idosos, pessoas com comorbidades e imunossuprimidos. A campanha de vacinação contra Covid-19 segue com aplicação da primeira à quinta dose. Ao total o estado, aplicou mais de 7 milhões de doses, tendo uma cobertura de 98% da população vacinada com a primeira dose e 97% com segunda dose e terceira dose ou dose única. Mesmo com uma alta cobertura vacinal, segundo o portal G1, na segunda semana de Janeiro de 2023, foram registrados 34 novos casos confirmados de Covid-19 e oito mortes em apenas 1 dia. A ocupação dos leitos alcançou 19% neste início de ano.